Pada mulanya berdiri Madrasah Ibtdaiyah Salafiyah pada tahun 1969, sebagai kelanjutan dari madrasah diniyah yang telah berdiri sejak tahun 1954. Mengingat tamatan Madrasah Ibtdaiyah setiap tahunnya meningkat, serta masih adanya ruangan kosong yang jumlahnya satu ruang, maa pada tanggal 1 Oktober 1968 didirikan Madrasah Tsanawiyah Agama Islam Salafiyah ( MTs AIS ) oleh pengurus Ibtidaiyah Salafiyah, yaitu :
- Yth. Bapak K.H Hambali
- Yth. Bapak H. Khaerudin Hadi
- Yth. Bapak R. Mukhidin BA
Dan serta didukung oleh masyarakat, pemerintah, serta alim ulama setempat, yang menjadikan latar belakang didirikannya MTs As - Salafiyah adalah :
- Menyalurkan hasrat dan aspirasi masyarakat Islam bodelor melalui para pengurus Madrasah Salafiyah.
- Menampung serta mempermudah kesempatan bagi para murid tamatan MI atau SD untuk melanjutkan ke jenjang berikutnya ( SLTP ) yang ada didesa.
- Mengembangkan pendidikan agama Islam di sekolah lanjutan tingkatan pertama, mengingat lembaga-lembaga agama pada tingkat SLTP pada saat itu masih sangat langka.
Madrasah Tsanawiyah Agama Islam Salafiyah sejak awal berdirinya tahun 1969 s.d tahun 1978/1979 menginduk ke Madrasah Tsanawiyah Negeri Babakan Ciwaringin Cirebon. Pada tahun 1980 sampai 1984 nama MTs Al Salafiyah dirubah menjadi MTs Salafiyah dan beralih induk ke MTs Negeri 1 Pilang Cirebon. Pada tahun 1984/1985 MTs Salafiyah kembali menginduk ke MTs Negeri Babakan Ciwaringin. Pada tahun 1985/1986 sampai bulan Agustus 2010 MTs Salafiyah Bode menginduk ke MTs Negeri Arjawinangun Cirebon. Pada akhir Agustus 2010 MTs Salafiyah menginduk ke MTs Negeri Cirebon II. Sejak tahun 1969 sampai 1976 MTs Salafiyah dikelola oleh Pengurus Yayasan Lembaga Madrasah Salafiyah yag dipimpin oleh Al Mukarrom Bapak K.H. Hambali. Pada tahun 1976 lembaga tersebut berubah menjadi Yayasan Lembaga Pendidikan Agama Islam As-Salafiyah (YLPAIS), Yayasan tersebut dipimpin oleh Bapak K.H Hambali sampai dengan tahun 1982. Dan pada tahun 1983 Yayasan Lembaga Pendidikan Agama Islam As Salafiyah dipimpin oleh Bapak H. Haerudin Hadi sampai sekarang. Dengan demikian MTs Salafiyah Bode sejak tahun 1976 sampai sekarang dibawah naungan Yayasan. Sejak dirubahnya lembaga Yayasan Salafiyah menjadi Yayasan Lembaga Agama Islam Salafiyah Bode, mengalami perkembangan dan kemajuan yang cukup pesat, baik kwalitas pendidikan dan pengajaran maupun kuantitas pendidik, jumlah siswa, keuangan, sarana, dan kwalitasnya.
Hal ini dapat dilihat dari adanya perubahan status sejak tahun pelajaran 1969 sampai 1991/1992 MTs Salafiyah berstatus "TERDAFTAR", dan pada tahun pelajaran 1992/1993 status menjadi "DIAKUI", dan mulai tanggal 17 Juni 1999 statusna meningkat menjadi "DISAMAKAN". Pada tanggal 25 Maret 2006 MTs Salafiyah diakreditasi oleh tim Depag Kabupaten Cirebon, dengan akreditasi "A" ( Sangat Baik ) yang menandakan nilai tertinggi. Adapun Kepala MTs Salafiyah sampai sekarang tetap dipgang oleh Bapak H. Haerudin.
